湖南农业大学高等教育研究所成立于1992年，原设在湖南农业大学教务处，2001年获准设置高等教育学硕士学位点，高教所划归公法学院（原人文学院），2012年，教育学一级学科硕士点申报成功，高教所并入教育学院（原科学技术师范学院），现有教育学硕士学位点和教育与乡村人才振兴二级学科博士点。高教所自2002年招生第一届高等教育硕士研究生以来，迄今已培养400多名硕士研究生，服务于全国多所高校和企事业单位，人才培养质量得到用人单位的肯定。

高等教育研究所坚持以高等教育基本理论研究为基础，注重高等教育实践应用研究，突出高等农业院校研究特点，在地方高校治理、高校内部管理制度改革、高等农业教育、跨国高等教育等方面的研究具有鲜明特色。近五年来，本所现承担包括国家级课题4项，其中含国家社科基金重点项目1项，省厅级科研项目20余项。出版教材专著5部，发表高水平论文40余篇，获省部级科研奖励10余项，其教学团队荣获“湖南省研究生优秀教学团队”称号，“高级教育管理学”课程获“湖南省优秀研究生课程”。

高教研究所在学科建设和人才培养的基础上，积极为本校和相关院校的发展改革提供咨询、服务、决策参考。经过30多年的建设与发展，高教所已逐步成为特色鲜明，研究力量较强，学术成果丰富，具有自身特色的全国优秀高等教育研究机构之一。